MicroRNA测序

small RNA包含了很多类型的小RNA，其中miRNA是研究最为广泛，研究比较成熟的小RNA。
miRNA是一类内生的、长度约为21-23个核苷酸的小RNA，其在细胞内具有多种重要的调节作用。
miRNA的作用机制是与mRNA互补，让mRNA沉默或者降解。每个miRNA可以有多个靶基因(mRNA,circRNA)，而几个miRNA也可以调节同一个基因。这种复杂的调节网络来调控基因的表达。

分析流程：

分析图例：

案例分享
Integrative analysis of long noncoding RNAs dysregulation and synapse-associated ceRNA regulatory axes in autism      
孤独症长链非编码RNA失调与突触相关ceRNA调控轴的综合分析

孤独症谱系障碍(ASD)是一种复杂的神经发育障碍性疾病，本研究利用基因网络，整合多种数据类型(如RNA表达、全外显子组测序信号、加权基因共表达网络分析和蛋白质相互作用)探索ASD的发病机制。

388个lncRNA和5个共表达模块在ASD中发生改变，整合来自M4模块的lncRNA和来自文献的miRNA数据，确定竞争性内源RNA (ceRNA)网络；发现MIR600HG在多个脑组织数据集中下调，并与ceRNA网络中的9个自闭症易感miRNA密切相关，MIR600HG敲低后，部分突触相关mRNA表达下调。