转录组测序服务

宏转录组测序技术(Metatranscriptomic sequencing)通过对特定时期、特定环境样品中所有微生物群落的转录本进行大规模高通量测序,可以直接获得环境中可培养和不可培养的微生物转录组信息。这种技术不仅具有宏基因组技术的全部优点,可以检测环境中的活性微生物、活性转录本以及活性功能进行研究,还可以比较不同环境下的差异表达基因和差异功能途径,揭示微生物在不同环境压力下的适应机制,探索环境与微生物之间的互作机理。

适用范围
1. 医药领域:人体微生物与疾病关系的研究、分子标志和药物靶点的筛选鉴定等;
2. 生态领域:生物互作、微生物制剂的开发、生物代谢调控研究等;
3. 工业领域:微生物活性物质开发、生物能源、环境污染监控与生物修复等。

 送样要求

 土壤:10 g;粪便:3-5 g;污泥/沉积物:5-10 g(取样后应尽快-80℃保存,干冰运输)
 RNA:总量 ≥ 4 μg、浓度 ≥ 100 ng/μL、有明显主条带;
 cDNA:必须为双链、总量 ≥ 1 μg、浓度 ≥ 20 ng/μL

生物信息分析

宏转录组测序项目,不仅进行基因表达情况以及差异基因表达分析,还进行物种注释及分类分析,多样品间的比较分析等。可以提供个性化分析的服务,可以根据客户需求定制分析内容

De novo拼接
物种注释及分类
功能注释(KEGG,eggNOG,CAZy)
Nr数据库比对
GO富集
KEGG富集
多样品比较分析